BigSolDB 2.0:化学信息学研究的有机化合物溶解度新数据集发布

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近日,一项重要的研究成果发布,即BigSolDB 2.0数据集的推出。该数据集汇集了海量的有机化合物溶解度数据,旨在为化学信息学领域的研究提供强有力的支持,并显著提升溶解度预测的准确性。

BigSolDB 2.0包含103,944个实验测定的溶解度数值,涵盖了1,448种有机化合物,涉及213种不同的溶剂。这些数据是在243 K至425 K的宽广温度范围内测量的,其信息来源是1,595篇经过同行评审的学术文章。为了方便研究人员使用,一个基于网络的工具也一并开发,支持数据的可视化和检索。

溶解度是决定有机化合物在化学、材料科学及制药领域应用的关键性质之一。然而,从分子结构预测其在水以外的溶剂中的溶解度,在现代化学信息学中仍然是一项挑战,这在很大程度上归因于缺乏大规模且多样化的数据集。BigSolDB 2.0的出现,正是为了填补这一空白,为机器学习模型在溶解度预测方面的开发和验证提供了一个全面的基准。研究人员指出,高质量且数量充足的数据集是成功预测的关键要素之一。

在化学信息学领域,利用机器学习(ML)和深度学习(DL)技术来预测溶解度已成为一个日益重要的方向。近年来,图神经网络(GNNs)、循环神经网络(RNNs)以及自然语言处理领域衍生的Transformer模型等先进的机器学习方法,已被应用于预测不同温度下的溶解度,从而指导具有最佳溶解度的分子设计。这些数据驱动的方法能够快速预测溶解度,为药物研发等领域节省了宝贵的时间和资源。

此外,BigSolDB 2.0的发布也凸显了化学信息学在解决复杂科学问题中的核心作用。尽管化学信息学取得了显著的进步,但在数据标准化、互操作性和可重用性方面仍面临挑战,尤其是在处理复杂分子时。因此,高质量、标准化的数据集对于开发更精确、更稳健的计算方法至关重要。BigSolDB 2.0的全面性和可用性,有望加速化学和材料科学领域的研究进程,为新材料和新药物的开发提供坚实的基础。该数据集的推出,标志着在利用数据驱动方法理解和预测分子性质方面迈出了重要一步,为相关领域的深入研究开辟了新的可能性。

来源

  • Nature

  • BigSolDB 2.0: a dataset of solubility values for organic compounds in organic solvents and water at various temperatures

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